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预测丝氨酸,苏氨酸或酪氨酸残基的潜在磷酸化位点

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NetPhos是一种基于神经网络的方法(磷酸化位点周围氨基酸的重要意义),用于预测蛋白质序列中丝氨酸,苏氨酸或酪氨酸残基的潜在磷酸化位点。输入FA格式的蛋白氨基酸序列,NetPhos 2.0(http://www.cbs.dtu.dk/services/NetPhos-2.0/)版本可进行通用磷酸化位点预测,预测位点类型可选Tyr、Ser、Thr。分析结果包含三部分,输入序列名称和氨基酸序列以及预测磷酸化位点信息;每种氨基酸(Ser、Thr、Tyr)磷酸化位点详细信息;预测结果的图片展示。其中Pos表示分析的氨基酸位置(磷酸化位点),Context表示包含分析位点的9个氨基酸序列,Score为预测结果打分(0-1),Pred为对结果评估,打分高于0.5则为*S*、 *T*或 *Y*。

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2 条评论

  • lulu
    lulu 游客

    请问如何理解NetPhos预测结果中的unsp-没有特异性激酶预测结果呢,但同时又有为yes的激酶的预测结果

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    • admin

      -_-||专业问题都问过来了,我不熟悉,只是收录这个网站~

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